Мазок на скрытые инфекции и полимеразная цепная реакция (ПЦР) позволяет обнаружить инфекции, которые невозможно выявить при анализе мазка на флору. При исследовании мазков, нужно выделить какой вид инфекции вызывает заболевание. Но бактерий иногда бывает настолько мало, что распознать их невозможно. И тут нас спасает ПЦР диагностика.

Для проведения исследования берут участок ДНК бактерии и клонируют его, до того момента пока ДНК не вырастет, и даст возможность идентифицировать с каким видом бактерий или грибков мы имеем дело. ПЦР диагностика дает  точный результат. Она позволяет выявить половые инфекции на ранних стадиях  развития, когда большинство венерических заболеваний, к примеру, гарднереллез, хламидиоз, микоплазмоз, гонорея, уреаплазмоз, не дают никаких симптомов. При использовании данного метода можно выявить так же вирусные инфекции (гепатит, цитомегаловирус, вирус папилломы человека).